虎杖悠仁是一位身手比一般青少年優秀許多的高中生。爺爺去世那天，他遇見了伏黑惠，一位就讀於東京都立咒術高等專門學校的一年級生。惠前來取回虎杖手上的咒物，但它的封印被虎杖的前輩揭開了。許多詛咒受到咒物的吸引，開始攻擊虎杖的前輩，虎杖和伏黑急忙趕去救援。
虎杖在一個陌生的房間內醒來。出現在虎杖眼前的是五條悟，咒術高專的導師。虎杖被告知他將被秘密處死刑，而五條給了他兩個選擇：馬上被處死，或蒐集並吞食全數二十根宿儺的手指之後再被處死…
虎杖、伏黑和五條前去迎接第三位一年級生釘崎野薔薇。之後，他們前往一棟廢棄的屋。五條要求虎杖和釘崎祓除屋內的咒靈。虎杖和釘崎兵分兩路，最後他們與一個挾持孩子的狡猾咒靈發生正面衝突。
虎杖、伏黑和釘崎被派往處理在少年院發生的緊急事件。他們的任務是搜尋以及救出倖存者，同時取回即將變成特級咒靈的咒胎。虎杖一行人潛入少年院之後，馬上就面臨了一個殘酷的事實。釘崎不久後便消失了，而一個特級咒靈出現在虎杖和伏黑的眼前。
伏黑從少年院撤退，他感應到特級咒靈已被祓除。但在下一秒鐘，兩面宿儺現身，並把虎杖的心臟挖了出來，將他作為人質。伏黑與宿儺進行交戰，他知道如果虎杖現在清醒過來便必死無疑。但他跟宿儺的實力差距實在太過巨大。
虎杖的死讓沮喪的五條陷入思考。痛失同學的伏黑和野薔薇則開始跟二年級生進行訓練，期望能變得更強。在另一邊，夏油和他的同夥準備出動。與此同時，已經死去的虎杖…
五條出動時，中了特級咒靈漏瑚的埋伏。不過漏瑚也見識到了五條真正的實力，所有攻擊都對他無效。五條甚至瞬間移動到咒術高專，把在認真訓練的虎杖帶來。漏瑚怒不可遏，想出了一個對付五條的辦法…
學生們正在為交流會進行特訓，當他們稍作休息時，就讀於京都府立咒術高等專門學校的二年級生禪院真依以及前輩東堂與釘崎和伏黑發生了衝突。伏黑用盡全力抵抗東堂，而釘崎則被真依所帶來的訊息惹怒並和她對峙，不過…
吉野順平逃學去看電影，但卻看到平常欺凌他的惡霸臉部扭曲變形後慘死，他叫住並追上了兇手。在那之後，虎杖和一位名叫七海建人的前上班族以及一級咒術師來到事發的戲院，並且遇上了兩個咒靈。
輔助監督伊地知告知被派去調查吉野的虎杖他的計畫。原本是打算讓低級詛咒攻擊吉野，然後觀察他的反應，但計畫失敗了，導致虎杖與吉野正面接觸。吉野看到虎杖把麻煩的班主任趕走之後，便同意回答虎杖的問題。與此同時，七海成功潛入真人的藏身之處，並且在下水道與他相遇。
被真人逼入絕境的七海將咒力解封，使出十劃咒法“瓦落瓦落”，摧毀了整個下水道。與此同時，吉野和虎杖因為都熱愛電影而相談甚歡。虎杖也見到了吉野的母親，在吉野邀請虎杖去家裡做客之後，他們的關係更友好了，不過…
真人成功地利用吉野對他的崇拜，逼迫他與虎杖交戰。當吉野為了復仇而失去理智時，虎杖一邊與他對戰，一邊詢問他的動機，但他從吉野口中聽見了殘酷的真相。接著，真人悄悄地來到他們身後…
七海在千鈞一髮之際從真人手中救出虎杖，他們試圖聯手徹底祓除真人。真人利用變形人擾亂虎杖，但虎杖戰勝了心理壓力。在不斷遭受攻擊後，真人瀕臨死亡…
從虎杖和七海手中逃脫之後，真人跟夏油會合，準備開始執行他的計畫。在另一邊，京都姐妹校交流會即將開始。伏黑和釘崎跟真希、棘和熊貓碰頭，但京都校的學生也同時出現了，情勢一觸即發。此外，遲到的五條在匆忙趕來的同時，也帶來了一個驚喜…
京都姊妹校交流會團體戰正式開始。京都咒術高專的東堂本應攻擊東京咒術高專的學生，但最後卻對上了前來阻止他的虎杖。虎杖被東堂的強大力量逼入絕境，接著東堂突然問虎杖喜歡哪一類型的女人…
東堂指出虎杖的逕庭拳對特級咒靈毫無用處，虎杖將他的建議銘記於心，而東堂透過認真的戰鬥指引虎杖。在另一邊，釘崎對上京都咒術高專的西宮。熊貓埋伏在旁，但機械丸從暗處向他發動攻擊。釘崎與西宮、熊貓與機械丸的戰鬥就此展開。
交流會團體戰繼續進行，真希和三輪正面交鋒。目睹真希真正的實力後，三輪大吃一驚。與此同時，西宮騎在飛天掃帚上追擊釘崎。西宮敘述著真依所經歷過的磨難，以及當一位女咒術師的艱辛歷程。不過，釘崎充耳不聞並發動反擊。至於尚未出現的真依…
第一天的交流會團體戰接近尾聲，伏黑對上了加茂，咒術界御三家的其中一位繼承者。伏黑用他的式神和優越的反應力對抗加茂的赤血操術，一種能控制自己血液的術式。與此同時，狗卷用他的“咒言”控制戰鬥的步調，這是一種賦予語言力量，令人唯命是從的術式。不過，他突然感到一陣不安，當他轉身時，等著他的居然是…交流會有了出乎意料的發展，結果究竟會如何呢？
一個名叫花御的特級咒靈突然襲擊交流會。加茂、伏黑和狗卷抵抗花御的攻擊，同時試圖跑到帳之外。當一切看似絕望時，真希突然出現，並與伏黑聯手發動反擊，但他們仍舊敵不過強大的花御…
虎杖和東堂也加入與花御的戰鬥。虎杖使出黑閃，當兩人聯手擊退花御時，東堂也決定揭露他的術式。東堂跟他的摯友虎杖並肩作戰，他用機智的術式以及自稱智商超過53萬的聰明頭腦應戰，不過…
五條用強大的力量擊敗了花御。真人與瀕臨死亡的花御碰頭，並拿走了宿儺的手指以及咒胎九相圖一至三號。他開始策劃10月31日的行動，打算把五條封印起來。在另一邊，咒術高專無法看透真人真正的目的。交流會本來因人員傷亡而打算取消，但最後他們決定改打棒球賽。交流會第二天的比賽項目是棒球，比賽開始！
一個咒靈導致三個男人以相似的方式死去。在發現三人都曾就讀於同一所國中後，虎杖、伏黑和釘崎被派去調查。抵達目的地時，他們才發現這也是伏黑的母校。他們聽說所有受害者都曾在當地的靈異地點八十八橋下失去意識。此外，他們也發現伏黑的姊姊津美紀也被牽扯其中…
除了八十八橋的詛咒之外，虎杖一行人也遇上了咒胎九相圖之一的血塗。他們本應被困在八十八橋詛咒的結界中，但釘崎突然被某人抓住手臂並拉到結界外。虎杖追上去時，與血塗一起來到結界外。伏黑被留下來獨自面對八十八橋的詛咒，並且看見了一個驚人的景象。在另一邊，釘崎則對上了另一個咒胎九相圖壞相。當血塗和虎杖加入戰場後…
虎杖和釘崎在與咒胎九相圖兄弟檔壞相和血塗對戰時，因為身體接觸到血塗的血液而開始腐爛。在危機之中，釘崎用釘子刺傷自己，施展出共鳴，一場忍痛大賽就此展開。虎杖拒絕投降，繼續攻擊血塗，但是…這場戰鬥似乎跟兩面宿儺的手指有關聯，虎杖、釘崎和伏黑能安然地返回咒術高專嗎？
