表面上是個平凡高中生的奉晳隱藏著祕密。高三最後一個學期開學這天，在上學公車上讓奉晳心動的女學生偶然轉學到奉晳班上。與此同時，隨著偽裝成快遞員的法蘭克開始送貨，首爾市中心發生可疑的意外。
美賢長時間背著奉晳隱藏他的超能力，她認為過去這段時間都躲藏得很好，沒有被人發現。美賢看到被上傳至社群媒體卻又消失的可疑事件後漸漸感到不安。法蘭克收到某人的指令，動身尋找躲藏起來生活的超能力者。
我們好像很合拍！奉晳和喜秀找到彼此的共通點並親近起來。他們變得越親近，奉晳就越難掩飾自己的心動，並陷入超能力被發現的危機。
奉晳的祕密還是被發現了！喜秀將無法控制身體的奉晳送回家。美賢擔心喜秀發現奉晳的超能力，為此感到坐立不安，但喜秀並未表現出訝異的反應。另一方面，法蘭克前往購物商場尋找第三個目標。
為了守護奉晳的祕密，喜秀也把自己的祕密告訴他。喜秀將她在前一所學校的回憶娓娓道來。洙源經過購物商場命案現場時發現了可疑的狀況。
被靜電害得總是孤身一人的啟道，憑藉著靜電成為閃電俠音樂劇的主角，但他的閃電俠之路走得並不平穩。國情院打聽到法蘭克的情報，而法蘭克正朝著下一個目標而去。
我是誰？法蘭克在除掉目標時回想起自身的過去。法蘭克走後，美賢更加嚴格管束及控制奉晳。奉晳被壓抑的情感噴湧而出。
在1994年的安企部，情報分析官美賢受閔容俊次長指示，對黑色要員金斗植進行思想檢驗。美賢故意接近斗植，並在他身邊徘徊。斗植逐漸察覺美賢的存在。美賢的作戰能否不被察覺，且成功執行呢？
斗植與美賢因互相分享祕密而變得親密。斗植提議瞞著閔次長持續進行作戰。某天，閔次長突然中止美賢的任務，並指派斗植進行機密任務。
1990年，洙源以怪物般的能力領導浦項派接管蔚山。然而不久後，他遭到組織背叛並成為亡命之徒，躲在仁川一家汽車旅館裡度日。就在洙源失去人生方向徘徊的某一天，智熙出現在他面前。
洙源為了和智熙見面而不停地點咖啡外送。在與洙源對話的同時，智熙漸漸打開了心房。某一天，正要回到住處的洙源聽見智熙的慘叫聲，並為了救她破牆而入。
1994年夏天，銷聲匿跡的斗植來到美賢的公寓前。然而安企部的要員們早就在監視著美賢，斗植因此遭到逮捕。斗植尋求永遠擺脫閔容俊次長的辦法。
黑色小組解散後，被指派做文職工作的洙源難以適應，想念起外勤第一線。這時閔容俊次長再次出現在他面前，表示為了重建黑色小組，而要指派任務給他。
在2003年的清溪川，參與反對攤位拆除示威的尹英遭到逮捕，才滿試圖用蠻力解救妻子。洙源受命前往制服才滿，怪物間的決鬥開始了。
美賢和洙源看了禮堂意外的影片，察覺到奉晳和喜秀就讀旌元高中並非巧合後，兩人便向旌元高中出發。奉晳和喜秀為了前往體育中心而搭上了公車。啟道注視著尾隨他們上車的可疑男子。
執教的生活如何呢？美賢的提問讓日煥回首了過往。為了甩開準華，啟道在道路上疾駛。
喜秀和奉晳抵達體育中心。奉晳不在時，喜秀遭到準華的攻擊，奉晳為了拯救喜秀而覺醒了。另一方面，洙源和美賢遇上了進入學校的北韓要員們。
消失的斗植在哪裡呢？美賢向德潤詢問斗植的下落。斗植為了作戰前往北韓的模樣就此展現。
才滿的加入看似逆轉了戰勢，但隨著新的北韓超能力者在夕登場，使戰況迎來了新局面。準華為了與北韓軍隊會合而前往旌元高中。
父母和孩子為了守護彼此而賭上性命奮戰到最後。這場跨越世代反覆的鬥爭會結束嗎？
